参考答案：D

解析：猪囊尾蚴病是由寄生在人体内的猪带绦虫的幼虫-猪囊尾蚴寄生于猪的肌肉和其他脏器中引起的一种人畜共患的寄生虫病。猪囊尾蚴检查是肉品卫生检验的重点项目，肉品卫生检验时，在肌肉中特别是在咬肌、心肌、舌肌发现囊尾蚴，即可确诊。因此，猪囊尾蚴在猪体内的主要寄生部位是肌肉。