参考答案：C

解析：

生物多样性是指在一定时间和一定地区所有生物（动物、植物、微生物）物种及其遗传变异和生态系统的复杂性总称。由此可见生物多样性包括基因（遗传）多样性、物种多样性和生态系统多样性三个层次。故选C

考点：本题考查生物多样性的层次。