参考答案：D

解析：噬菌体是病毒，根霉是真核生物，故A错。细菌是原核生物，草履虫是真核生物，故B错。蓝藻是原核生物，酵母菌是真核生物，故C错。衣藻和变形虫都是真核生物，故D正确。考点：本题考查生物分类相关知识，意在考查考生能理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系能力。