参考答案：D

解析：线粒体和叶绿体都具双层膜结构，A项正确；基质中都含有少量的DNA分子，都属于半自主性细胞器，B项正确；线粒体是有氧呼吸的主要场所，是细胞的“动力车间”，而叶绿体能把光能转化为化学能储存在有机物内，是能量转换站，故二者都与能量转换有关，C项正确；酶具有专一性，线粒体含与有氧呼吸有关的酶，而叶绿体含与光合作用相关的酶，D项错误。考点：本题考查线粒体和叶绿体的比较，意在考查考生能运用所学知识与观点，通过比较、分析与综合等方法对某些生物学问题进行解释、推理，做出合理的判断的能力。