参考答案：D

解析：

多肽中B（氨基酸）的数目等于C（肽键）的数目加上肽链的数目，A错；蛋白质分子的化学元素组成是至少含有C、H、O、N，有的含有P、S等，B错；基因多样性是生物多样性的根本原因，C错。氨基酸形成多肽的方式是脱水缩合，D正确；

考点：本题考查蛋白质的相关知识，意在考查考生识记所列知识点，并能运用所学知识做出合理的判断或得出正确的结论的能力。