参考答案：D

解析：我国《矿产资源法》第3条规定：“矿产资源属于国家所有，由国务院行使国家对矿产资源的所有权。地表或者地下的矿产资源的国家所有权，不因其所依附的土地的所有权或者使用权的不同而改变。可见，在我国矿产资源所有权是由国务院来行使的。选项D正确。