参考答案：

整理档案只能按文件的历史（有机）联系进行。

（1）从档案的形成特点看，档案作为人类社会实践活动的真实记录，必然有着与这种过程相吻合的有机联系。整理时保持这种联系，就易于反映历史原貌，向人们提供珍贵的原始凭证和信息；

（2）这样，也便于利用文件形成时的原基础；

（3）从利用规律看，档案之所以对各种用户有用，是因为它所记录的活动过程与各种事物有关。日后的用户正是从这一角度需要利用这些档案，故依据与这种过程相吻合的历史联系整理档案，就便于大多数用户利用；

（4）原本比较分散的档案文件也只有如此组成有机的整体才能充分显示其真实的价值并可便于鉴定；