参考答案：B

解析：君主专制的强化与城市人口数量没有变化，城市化陷入停滞不存在根本联系，故A项错误；明初到清末中国依然处于封建社会，政府坚持“重农抑商”政策，从而使自然经济进一步发展，农村人口迅速增加，故B项正确；闭关锁国政策不利于中外的经济文化交流，阻碍了中国社会的进步，与城市化停滞无根本联系，故C项错误；宋明理学的消极影响是禁锢了中国读书人的思想，故D项错误。