参考答案：A, B, E

解析：选项A．用于集体福利的外购货物，进项税额不得抵扣；选项B，管理不善造成被盗的购进货物，进项税额不得抵扣；选项C，自然灾害不属于管理不善造成的，故相应的进项税不用转出；选项D，购入生产用的机器设备，其进项税额允许按规定抵扣；选项E，用于企业在建工程的外购货物，其进项税额不得抵扣。