参考答案：

（1）在生物进化史上的作用：蓝细菌是池塘、湖泊、河流及海洋等水中好氧菌，种类庞杂，古老的原核生物，在地球发展史上，使地球大气由无氧状态变为有氧状态。

（2）有经济价值的蓝细菌：发菜念珠蓝细菌、地耳、盘状螺旋蓝细菌。

（3）有的蓝细菌是污染湖泊中发生赤潮、水华的原凶。