参考答案：C

解析：

A项错，自然选择过程中，直接受选择的是表现型；B项错，地理隔离导致种群基因库出现差异，可能导致生殖隔离；C项对，自然选择是指自然环境对个体进行选择，保留种群的有利基因，新基因产生的是基因突变；D项错，基因突变具有多害少利性，不能决定生物进化的方向，可能与进化的方向相同，也可能不同。

考点：本题考查现代生物进化理论。

点评：本题难度中等，属于考纲理解层次。解答本题的关键是理解现代生物进化理论的内容。