参考答案：D

解析：当物体的大小和形状对我们所研究的问题影响不大，可以忽略时我们可将物体看做一个有质量的点，即质点，物体能否看做质点不是根据物体的大小来判断的，原子很小，但是研究原子内部结构时，原子不能看做质点，A错误；研究日食时，需要用到太阳的大小，不能忽略大小，所以不能看做质点，B错误；两飞船对接时，需要研究局部位置关系，所以不能看做质点，C错误；研究太空中飞船的运动，飞船的大小可以忽略，可以看做质点，D正确。