参考答案：A

解析：

种群是生物进化和繁殖的基本单位，A正确；自然选择导致种群的基因频率改变，B错误；变异是本来就存在的，通过繁殖在后代表现出来，C错误；突变本来就存在，自然选择对突变性状进行选择，从而使基因频率发生定向的改变，D错误。

考点：本题考查现代生物进化理论的相关知识，意在考查考生理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系的能力。