参考答案：D

解析：

地理隔离也能阻止种群间的基因交流，A错误；突变的形成并非自然选择导致，自然选择将有利的变异保存下来，将不利的变异淘汰，B错误；人为因素和物种入侵改变进化的速度和方向，C错误；进化的实质是种群基因频率的的改变，D正确。

考点：本题考查现代生物进化理论，意在考查考生识记所列知识点，并能运用所学知识做出合理的判断或得出正确的结论的能力。