参考答案：A

解析：

随机交配，生物交配是随机的、自由的，每一个个体与种群内的其他异性个体交配的机会是均等的，而且后代没有死亡等，那么基因重组不会改变种群的基因频率，故A正确。自然选择，会淘汰掉一定基因型的个体，当然会使基因频率改变，故B错。基因突变，会生成新基因，改变基因比例，故C错。染色体畸变会导致一些基因重复或丢失，会改变基因频率，故D错。

考点：本题考查生物进化相关知识，意在考查考生能理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系，形成知识的网络结构能力。