参考答案：B

解析：基因突变是不定向的，不能使种群基因频率发生定向改变，只有自然选择才能使种群基因频率发生定向改变，故A错误；基因突变能产生等位基因，基因间的自由组合能提高后代的遗传多样性，故B正确；个体的自然突变频率很低，但种群中的突变频率不低，因此对种群基因库的影响较大，故C错误；基因突变具有多害少利性，但能为生物进化提供原材料，有利于种群的生存和进化，故D错误。

考点：本题考查生物进化的相关知识，意在考查考生理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系的能力；能运用所学知识和观点，对生物学问题作出准确的判断。