参考答案：A

解析：

现代生物进化理论认为，种群是生物进化的基本单位，A正确；生物进化的过程实质上就是种群基因频率变化的过程，B错误；物种形成的标志是出现生殖隔离，C错误；生物多样性形成的原因共同进化，D错误。

考点：本题考查现代生物进化理论的知识。意在考查能理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系的能力。