参考答案：D

解析：

基因频率是指某种基因占该等位基因的比例，就A与a这对等位基因来说，每个个体可以看做含有2个基因。那么，这100个个体共有200个基因，其中A基因有2×30+60=120个，a基因有2×10+60=80个。于是，在这个种群中，A基因的基因频率为：120÷200="60%"，a基因的基因频率为：80÷200=40%。D项正确。

考点：本题考查基因频率的计算，意在考查考生能用文字、图表以及数学方式等多种表达形式准确地描述生物学方面的内容的能力。