参考答案：D

解析：

每条染色体有一个DNA分子，经复制后每条染色单体上有一个DNA分子，每条染色体上有两个DNA分子，A正确；基因在染色体上呈线性排列，每个DNA分子上有许多基因，B、C正确；基因不是在DNA分子双链上成对存在，而是在同源染色体上成对存在，D项错误。。

考点：本题考查基因在染色体上的相关知识，意在考查考生理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系的能力。