参考答案：

如果是驾驶员同时将收费卡和钱一起交给收费员，驾驶员所多交的差额部分应该由站内退给驾驶员，

如果是先交卡，后交钱，收费员工作失误（在没有核实应交正确金额时就按确认键），驾驶员所多交的差额部分应该由收费员自己赔偿。

同时应该多加强收费员的业务水平。总之，不论何种原因，均应该将多收的通行费退给驾驶员。