参考答案：

（1）在CTAIS中按：申报征收—征收—退税处理—开据小额退税凭证，进行发票预收款的金额退出，开据小额退税凭证。再进入发票预收款收取和退还管理模块，选择退还标志，输入纳税人识别号，输入退税凭证号（如果存在多个退税凭证号，显示选择列表框供用户选择），系统将本次退出金额根据退税凭证自动带出，同时发票预收款总额也自动带出，两项均不允许修改。

（2）选择“保存”，保存预收款修改信息。到此为止，纳税人的发票预缴款余额为退还后的正确余额。