参考答案：

常用微生物的生理代谢作用机制有：氧化（β-氧化、环氧化、氮氧化、硫氧化、甲基氧化）反应、还原（硫酸盐还原、双键还原、三键还原）反应、水解反应、脱基（脱卤、脱氨基、脱羧基）反应、羟基化反应、酯化反应以及代谢（氨代谢、腈代谢）