参考答案：

①致病微生物种类繁多，检测方法多种多样，对样品的卫生安全性作出评价时，不可能分别检测各种微生物；

②分离、鉴定致病微生物需要时长，不能满足实际工作的需要；

③分离、鉴定致病微生物费用高，而且对人员的技术要求也相对较高；

④即使不考虑上述因素，由于致病微生物的数量少，而且检测方法的灵敏度不高；或者受到检测量的限制可能导致假阴性结果。因此，通常以检测指示微生物间接反映样品的安全性。