①选项A：苹果的单价一定，也就是购买苹果的总价与数量的比值一定，符合正比例意义，所以购买苹果的总价与数量是成正比例关系．

②选项B：圆的面积=圆周率×半径的平方，推出：圆的面积：半径的平方=圆周率（一定），可以看出圆的面积只和半径的平方成正比例关系，和半径不成比例关系．

③选项C：圆的周长：直径=圆周率（一定），可以看出，圆的周长与它的直径成正比例关系．

④选项D：行驶的路程：时间=速度（一定），可以看出，当轮船行驶的速度一定时，行驶的路程和时间是成正比例关系．

故选B．