A、湖中的水，只包括了非生物部分的水，没有其它部分，也没有生物部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．

B、清水大闸蟹，只包括了生物部分的部分动物，没有其它生物，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．

C、湖中的芦苇，只包括了生物部分的部分植物，没有其它生物，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．

D、湿地风景区，既包括了湿地所在的环境，又包括了此环境中的所有生物，符合生态系统的概念，符合题意．

故选：D