（1）正方形的面积÷边长=边长（不一定），比值不一定，所以正方形的面积和边长不成比例，所以原题说法错误；

（2）因为正方形的周长÷边长=4（一定），是比值一定，所以正方形的周长和边长成正比例，原题说法正确；

（3）有单位的数量可以是整数、小数、分数，但不可以是百分比，所以原题说法错误；

（4）底面积×高=圆锥的体积×3（一定），所以体积一定时，圆锥的底面积与高成反比例，原题说法正确；

所以说法正确的有2个，

故选：B．