A、一个湖泊，既包括了湖泊所在的环境，又包括了此环境中的所有生物，符合生态系统的概念，符合题意．

B、一口池塘中的全部鱼，只包括了生物部分的部分动物，没有其它生物，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．

C、一片森林中的树木，只包括了生物部分的植物，没有其它生物，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．

D、一块农田里的水稻，只包括了生物部分的部分植物，没有其它生物，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．

故选：A