A、一块农田中的所有生物，只包括了生物部分，没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．

B、一片草原中的牧草，只包括了生物部分的部分植物，没有其它生物，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．

C、一个湖泊，既包括了这湖所在的环境，又包括了此环境中的所有生物，符合生态系统的概念，符合题意．

D、一片树林中的阳光、空气、水，只包括了非生物部分，没有生物部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．

故选：C