A、一块农田，既包括了农田所在的环境，又包括了此环境中的所有生物，符合生态系统的概念，符合题意．

B、一块农田中全部水稻，只有生物部分，没有非生物部分，不符合生态系统的概念，不是一个生态系统．不符合题意．

C、一个池塘中所有的鱼类，只包括了生物部分的部分动物，没有其它生物，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．

D、一个池塘中所有的鲤鱼，只包括了生物部分的部分动物，没有其它生物，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，不符合题意．

故选：A