A、一个养有金鱼和水草的小鱼缸，既包括了鱼缸所在的环境，又包括了此环境中的所有生物，符合生态系统的概念，不符合题意．

B、一块农田中的所有生物，只包括了生物部分，没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，符合题意．

C、植物园，既包括了此植物园所在的环境，又包括了此环境中的所有生物，符合生态系统的概念，不符合题意．

D、一条河流，既包括了河流所在的环境，又包括了此环境中的所有生物，符合生态系统的概念，不符合题意．

故选：B