A、淄川太河水库，即包括了水库所在的环境，又包括了此环境中所有的生物，是一个完整的生态系统，A不符合题意；

B、桓台奶牛场的一群奶牛，只包括了生物部分的动物，没有其它生物植物和细菌、真菌，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，B符合题意；

C、高青蔬菜基地，即包括了基地所在的环境，又包括了此环境中所有的生物，是一个完整的生态系统，C不符合题意；

D、博山原山国家森林公园，即包括了公园所在的环境，又包括了此环境中所有的生物，是一个完整的生态系统，D不符合题意．

故选：B．