答案：D

此题考查的是生态系统的概念，生态系统指在一定地域内，生物与环境所形成的统一整体，它由非生物部分和生物部分组成，

A、微山湖中的水，只有环境，不能构成生态系统，

B、只有植物，没有动物、细菌真菌等生物，也没有环境，也不能构成生态系统，

C、只包括了生物部分的部分动物，没有其它生物，也没有环境部分，不能构成一个完整的生态系统，

D、微山湖既包括了所在的环境，又包括了此环境中所有的生物，是生态系统。