参考答案：真核生物在转录水平的调控主要是通过反式作用因子、顺式作用元件和RNA聚合酶的相互作用来完成的，主要是反式作用因子结合顺式作用元件后影响转录起始复合物的形成过程。
①转录起始复合物的形成：转录因子TFⅡD结合到启动子TATA盒上，形成TFⅡD—DNA闭合复合物，而其他转录因子与RNA聚合酶结合形成一个开放复合物。
②反式作用因子具有3个功能域(DNA识别结合域、转录活性域和结合其他蛋白结合域)；能识别并结合上游调控区中的顺式作用元件；对基因的表达有正性或负性调控作用。
③转录起始的调控。
反式作用因子的活性调节：A．表达式调节——反式作用因子合成出来就具有活性，只在需要时才合成并迅速降解，不能积累；B．共价修饰——磷酸化和去磷酸化，糖基化修饰；C．配体结合——许多激素受体是反式作用因子，与激素结合后即被激活；D．蛋白质与蛋白质相互作用——形成同源或异源二聚体后才有调节活性。
反式作用因子与顺式作用元件的结合：反式作用因子被激活后，即可识别并结合上游启动子元件和增强子中的保守性序列，对基因转录起调节作用。
反式作用因子的作用方式：反式作用因子的结合位点一般离其所调控的基因或RNA聚合酶结合位点的距离较远，一般通过成环、扭曲、滑动、oozing等方式影响转录起始的调节。
反式作用因子的组合式调控作用：每一种反式作用因子结合顺式作用元件后虽然可以发挥促进或抑制作用，但反式作用因子对基因调控不是由单一因子完成的而是几种因子组合发挥特定的作用。

解析：真核生物基因转录水平上的调控主要是通过反式作用因子、顺式作用元件和RNA聚合酶的相互作用来完成的，本题主要从反式作用因子的结构特点、反式作用因子与顺式作用元件相互作用影响转录起始等方面作答。