参考答案：

党的建设的“新的伟大工程”主要包括两个问题：

一是把党建设成一个什么样的党，其核心是“领导全国人民建设有中国特色社会主义的马克思主义政党”，其中包括党的思想、理论、政治、组织和作风建设；

二是怎样建设党，包括全面加强党的建设的整体部署和重大举措。