参考答案：同源重组对之间需要有同源性。调节这一过程的蛋白质(如大肠杆菌中的RecA)不是序列专一性的，而是同源依赖的。经常涉及长的同源区域(如减数分裂中)。
位点特异重组对之间不需要同源性。调节这一过程的蛋白质(位点特异性重组酶)在供体和受体分子中识别短的特异DNA序列，这些蛋白质之间的相互作用帮助重组。供体和受体位点之间经常存在同源性，因为同样的重组酶蛋白可结合两者的识别位点。