参考答案：分子生物学原因。剂量补偿效应广泛存在于生物界，其现象复杂，机制各异。而且当两个X染色体中有一个失活时，也并不是全部基因都失活。例如，Xg血型基因和类固醇硫酸酯酶基因虽是X连锁基因，但并不失活。目前认为失活是从一个失活中心开始的，其位置很可能在X染色体长臂邻近着丝粒部位。有袋类动物的雌性个体细胞中，来自雌性亲本的X染色体有一个敏感区，它产生少许起控制作用的物质，这物质和同一条X染色体上的毗邻的受体相结合，能使该条X染色体不发生异固缩，保持不失活状态。但来源于雄性亲本的X染色体的相应部位没有，因而总是它发生异固缩而失活。有胎盘的哺乳动物和有袋类不同，敏感区不在X染色体上而是在常染色体上。敏感区产生的控制物质随机地和雄性或雌性亲本来源的X染色体上的受体结合，使相应的X染色体保持不失活状态。
X染色体的失活由X染色体上的失活中心(X-inactivation center，Xic)控制，这个中心就相当于常染色体上的印迹中心(imprinting center，IC)，破坏Xic就不会发生X染色体失活现象。Xic上有一个非常重要的基因叫做Xist，这个基因只在失活X染色体上表达，它的RNA不翻译为蛋白质，但可以结合在X染色体上，然后募集染色体失活相关的组分，譬如组蛋白去乙酰化酶(HDAC)、DNA甲基化酶等，引起染色体低乙酰化和甲基化，结果染色体就凝缩为异染色质。实验证明，如果把Xist基因插入常染色体，也会引起常染色体的基因失活。