参考答案：B

解析：

国内生产总值=第一产业增加值+第二产业增加值+第三产业增加值。材料给出了2008年第一、第二、第三产业各自的同比增长率，利用加权计算原理分析选项中四个城市各自2008年的国内生产总值同比增长率：

上海市：国内生产总值的增长率应该是在0.7%～11.3%之间；

扬州市：第一、二、三产业的增加值之比为117.47:897.71:558.11≈1:8:5，则其国内生产总值的增长率≈

杭州市：由于第二、三产业增加值之比≈1:1，则第二、三产业总的增加值的同比增长率，且第一产业增加值相较于第二、三产业非常小，所以其国内生产总值的增长率略小于11.4%；

宁波市：国内生产总值的增长率应该是在4.1%～11%之间，

综上分析，以上四个城市国内生产总值同比增长率最高的应该是扬州市，答案选B。