答案：A

题目分析：A、在元素周期表中，周期数等于电子层数，②⑤原子都有3个电子层，所以②⑤的元素在周期表的同一周期，正确，B、在元素周期表中，族数等于最外层电子数，但①虽然最外层电子数都为2，但属于稳定结构，它和其它稀有气体元素的原子处在同一族，错误，C、①只有一个电子层，且最外层电子数为2，③④⑤的最外层电子数都为8，都是稳定结构，但④质子数不等于电子数，就表示离子，而不是原子，错误，D、②③的质子数都为12，属于同种元素，但一个是原子，一个是离子，错误，故选A