参考答案：C

解析：

由材料的第一段得知，2009年，我国基础研究总投入达到270.3亿元，2009年高校基础研究经费为145.5亿元，根据假设，2009年研究机构基础研究经费占全国基础研究总经费的比重约为41%，则所求为145.5-270.3×41%=34.7亿元，与C项最为接近。