参考答案：

（1）病因：

A.细菌（弧菌、丝状细菌）、真菌（镰刀菌病）感染，固着类纤毛虫附生；

B.水质底质恶化，pH值长期偏低，水体氨氮和亚硝酸盐含量过高；

C.防治虾病时使用的药物不恰当，如硫酸铜、高锰酸钾（铜离子可直接损伤鳃丝，高锰酸钾的锰形成二氧化锰黏附在鳃丝表面，都可引起黑鳃）

D.长期缺乏维生素C（白黑斑病、黑斑病、黑鳃病）。

（2）诊断：剪取部分鳃丝做水浸片镜检：

A.鳃丝表面有污物附生，鳃组织并不变黑——丝状细菌、固着类纤毛虫、海藻引起的黑鳃

B.鳃丝组织坏死变黑——弧菌、镰刀菌等；非生物病因