参考答案：

（1）发酵设备上的死角造成灭菌不彻底。

（2）灭菌过程中假压力使灭菌不彻底，或流速控制的太快。

（3）玉米浆、酵母粉中有大量的芽孢杆菌，灭菌不彻底造成染菌。