答案：D

题目分析：生态系统的生物部分包括生产者、消费者和分解者，超级菌能够分解有机物，在生态系统中属于分解者，选项A正确；“超级细菌”是指耐药性很强的细菌，是普通细菌经过自然选择的过程进化而来的，在进化过程中抗生素的使用对细菌起到了定向的选择作用，选项B和C正确。从传染病的角度来看，传染源是指对某种传染病缺乏免疫力而容易被感染传染病的人或动物等，“超级细菌”是导致人或动物等患病的病原体，而不属于传染源，选项D不正确。