参考答案：

（1）自然科学基础：

①“星云说”

②地质“渐变论”

③能量守恒与转换定律

④尿素的人工合成

⑤细胞学说

⑥生物进化论

⑦电磁场理论

⑧元素周期律

从运用观察实验等经验方法收集积累材料阶段，进入到对所获经验材料进行综合整理并从理论上加以概括说明的阶段。

（2）自然哲学思想渊源：古希腊自然观中的辩证法观点，德国古典自然哲学特别是黑格尔的辩证法思想。