A、平行四边形是中心对称图形，它的中心对称点为两条对角线的交点，故该命题是真命题；

B、三角形三边的垂直平分线相交于一点，为三角形的外心，这点到三角形三个顶点的距离相等，故该命题是真命题；

C、用样本的数字特征估计总体的数字特征：主要数据有众数、中位数、平均数、标准差与方差，故该命题是真命题；

D、若x2=y2，则x=±y，不是x=y，故该命题是假命题；

故选D．