参考答案：A, B, C, D

解析：选项A，企业转让股权收入，应于转让协议生效、且完成股权变更手续时，确认收入的实现；选项B，转让股权收入扣除为取得该股权所发生的成本后，为股权转让所得；选项C，如果交易合同或协议中规定租赁期限跨年度，且租金提前一次性支付的，出租人可对已确认的收入，在租赁期内，分期均匀计入相关年度收入；选项D，涉农贷款和中小企业贷款进行风险分类后，按照规定计提的贷款损失准备金，准予在计算应纳税所得额时扣除。