参考答案：

（1）、填充作用。即生物体的硬体部分空隙，如骨髓腔、颅腔等被地下水中的矿物质（主要是碳酸钙）填充，化石保存了原有的组织结构，但物质成分增多，重量增加了。

（2）、置换作用。即生物体的硬体部分被地下水中的氧化硅、碳酸钙、黄铁矿等置换，化石保存了原有的形态和细微结构，但成分改变了，如硅化木等。