A、反应物和生成物都是两种物质，故不属于化合反应；故A判断不正确；

B、物质甲的分子由3个A原子和1个B原子构成，即物质甲是由A、B两种元素组成的化合物；故B正确；

C、根据质量守恒定律，化学变化前后原子种类、数目不变，反应前反应物的2个分子中共有6个A原子、2个B原子，而反应后生成物丙的1个分子中含2个B原子，则生成物乙的3个分子中应含6个A原子，则每个乙分子中含2个A原子；故C正确；

D、在化学反应中分子的种类发生改变；故D正确．

故选A．