参考答案：

（1）明清资本主义萌芽的出现，代表了中国社会进步发展的总趋势。

（2）资本主义萌芽只出现在少数地区的少数行业当中，是稀疏而又微弱的。

（3）资本主义萌芽发展非常缓慢，自然经济仍占统治地位。