参考答案：A,C,D

解析： (1)指定交割仓库的权利包括：①按交易所规定签发标准仓单；②按交易所审定的收费项目、标准和方法收取有关费用；③对交易所制定的有关实物交割的规定享有建议权等。
(2)指定交割仓库的义务包括：①遵守交易所的交割细则和其他有关规定，接受交易所的监管，及时向交易所提供有关情况；②根据期货合约规定的标准，对用于期货交割的商品进行验收入库；③按规定保管好库内的商品，确保商品安全；④按标准仓单要求提供商品，积极协助货主安排交割商品的运输；⑤保守与期货交易有关的商业秘密；⑥参加交易所组织的年审；⑦缴纳风险抵押金；⑧变更法定代表人、注册资本、股东或股本结构、仓储场地等事项，应及时向交易所报告；⑨每年初向交易所提交经审计的上年年度财务报告；⑩出现法律纠纷时，在三个工作日内应向交易所报告；⑥对外出具有关货物所有权证明函件时，应在证明函件落款日期的前三个工作日内向交易所报告等。
由以上可知，(1)的①和(2)的②说明选项A叙述正确；(2)的④说明选项C叙述正确。
另外，指定交割仓库应制定监督管理和责任追究等相关细则。所以，选项D是正确的。
因此，本题的正确答案为ACD。