参考答案：

（1）分析品种来源及亲缘关系：亲子鉴定、亲缘关系、杂种优势预测，

（2）某些经济性状的间接选择及疾病的预防，

（3）选择抗病品系，

（4）估测育成的新品种中不同品种的参与程度